{"id":359438,"date":"2012-11-13T00:14:48","date_gmt":"2012-11-13T00:14:48","guid":{"rendered":"legacy-k2-2009-32798"},"modified":"2012-11-13T00:14:48","modified_gmt":"2012-11-13T00:14:48","slug":"estudiante-de-ciencias-de-la-computacion-buap-desarrolla-metodo-para-reconstruir-el-adn-k2-32798","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pueblaonline.com.mx\/archivo\/2012\/puebla\/estudiante-de-ciencias-de-la-computacion-buap-desarrolla-metodo-para-reconstruir-el-adn-k2-32798\/359438\/","title":{"rendered":"Estudiante de Ciencias de la Computaci\u00f3n BUAP desarrolla m\u00e9todo para reconstruir el ADN"},"content":{"rendered":"<div>La tecnolog\u00eda actual no permite leer m\u00e1s de 500 o 700 bases, por lo que la observaci\u00f3n y estudio del ADN no es posible a trav\u00e9s del m\u00e9todo cl\u00ednico, pues tiene 3.2 millones de bases muy peque\u00f1as.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>Una manera de estudiar al ADN es por medio de su reconstrucci\u00f3n completa, para lo cual se emplean algoritmos gen\u00e9ticos, argument\u00f3 \u00c1ngel de Jes\u00fas L\u00f3pez P\u00e9rez, estudiante de la Facultad de Ciencias de la Computaci\u00f3n, en el inicio del Congreso Nacional de Ciencias de la Computaci\u00f3n CONACIC 2012, que realiza esta unidad acad\u00e9mica.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>Al presentar la ponencia \u201cUn algoritmo gen\u00e9tico para resolver el problema de ensamblado de fragmentos de ADN\u201d, mencion\u00f3 que los algoritmos gen\u00e9ticos fueron propuestos por John Henry Holland, en la d\u00e9cada de 1970. Son llamados as\u00ed porque se inspiran en la evoluci\u00f3n biol\u00f3gica y su base gen\u00e9tico-molecular.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>Estos algoritmos hacen evolucionar una poblaci\u00f3n de individuos someti\u00e9ndola a acciones aleatorias semejantes a las que act\u00faan en la evoluci\u00f3n biol\u00f3gica (mutaciones y recombinaciones gen\u00e9ticas), as\u00ed como tambi\u00e9n a una selecci\u00f3n de acuerdo con alg\u00fan criterio, en funci\u00f3n del cual se decide cu\u00e1les son los individuos m\u00e1s adaptados \u2013los que sobreviven\u2013 y cu\u00e1les los menos aptos \u2013mismos que son descartados.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>L\u00f3pez P\u00e9rez explic\u00f3 que el procedimiento para la fragmentaci\u00f3n del ADN es duplicar a \u00e9ste, cortarlo, secuenciarlo, hacer lecturas de bases, ordenarlas y crear un consenso, a partir de \u00e9ste se trabaja en el ensamblado de fragmentos.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>Es decir, primero se parte en fragmentos, como se desconoce el orden de cada uno, se utiliza la parte de traslape que indica cual va primero y cual despu\u00e9s para formar as\u00ed nuevamente la cadena que se fragment\u00f3 al principio.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>M\u00e1s tarde, se re\u00fanen los fragmentos en cadenas m\u00e1s peque\u00f1as todav\u00eda, pero m\u00e1s grandes que las que se cortaron. Este procedimiento es como una analog\u00eda de un libro que se corta en pedazos, los cuales se unen para saber c\u00f3mo estaba constituido.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>En el esquema general del experimento, el estudiante incluy\u00f3 la definici\u00f3n de los par\u00e1metros, su representaci\u00f3n, la creaci\u00f3n de la poblaci\u00f3n inicial, la evaluaci\u00f3n de cada individuo en base a la funci\u00f3n de costo, la selecci\u00f3n de pareja, reproducci\u00f3n y la mutaci\u00f3n. Igualmente aplic\u00f3 la funci\u00f3n de costo para traslapar cadenas de ADN.<\/div>\n<div><\/div>\n<div>Concluy\u00f3 que en las pruebas que realiz\u00f3 con el software Matlab, los resultados fueron \u00f3ptimos, por lo que pretende llegar a una implementaci\u00f3n real de este trabajo.<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La tecnolog\u00eda actual no permite leer m\u00e1s de 500 o 700 bases, por lo que la observaci\u00f3n y estudio del ADN no es posible a trav\u00e9s del m\u00e9todo cl\u00ednico, pues tiene 3.2 millones de bases muy peque\u00f1as. 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